當主後 1991 年 12 月 31 日中興教會租用的禮拜堂房東要收回自用不再續租的期限將到時，當時任中興教會牧師的張金城牧師，就積極尋找中興教會新禮拜堂的地方，在 1991 年的感恩節找到了敦化北路二三八巷七號一樓約六五坪，很適合當教會禮拜堂之用，在暖暖教會陳宗明長老夫婦的協助下，就在聖誕節簽約以 1,500 萬元購買下來。
在主後 1992 年教會經過多次開會討論，雖然贊成將禮拜堂遷移的信徒佔多數，但為了響應二千年福音運動開拓新教會的異象，於八月教會小會議決在敦化北路二三八巷七號一樓開拓新教會，並積極籌備開拓事宜，自十月起張牧師請辭中興教會牧會工作，志願負責開拓教會事工，且由中興教會派二位現任長老協助牧師負責開拓事宜，並撥 150 萬元做為開設教會經費。
從 1992 年 10 月 1 日起就開始週間各種聚會，於 10 月 18 日下午三點敦請七星中會傳道部主持敦化教會開幕感恩禮拜，財產歸屬於財團法人北部台灣基督長老教會七星中會。
主後 1993 年 1 月 3 日中會派許尚武長老宣佈敦化教會教會升格為堂會。
主後 1993 年 2 月 14 日舉行慶祝敦化教會升格堂會暨張金城牧師就任首任牧師就任典禮。
主後 2001 年 3 月 12 日以 1,580 萬元購買敦化北路二三八巷九號一樓做為敦化教會教育中心，財產歸屬於財團法人北部台灣基督長老教會七星中會。敦化教會重視信徒靈命培育，每週藉著週報豐富的內容提供信徒靈修的資料，重視以教會為家，藉著每主日中午愛餐的服事，彼此分享，重視莊嚴的敬拜。
藉著主日上午十時與晚上八時的主日禮拜，養成禮拜天一定要做禮拜的生活，重視社區宣教、成立敦化教會社區生活學苑與基督教女青年會配合從事婦女教育，成立社區活力團契與里長和社區結合推動桌球及才藝教學，重視牧長聯誼及運動，教育中心開放給牧長桌球運動與聯誼。
今年主後 2010 年十月適逢設教十八週年，教會積極配合總中會一領一，新倍加宣教運動，讓教會更進步、更增長，以達創設教會的目標與精神，這就是我們的使命。
