教會設立：1993 年 4 月 18 日
中崙教會自 1963 年開拓以來，相繼開拓中坡、東湖教會，並以水源教會做為設教三十週年的獻禮。
1991 年 9 月 8 日中崙長執會初議：以七星中會轄境為原則，由開拓小組積極物色地點。 經過多次勘察，選定了位於新台五路旁一棟七層雙併公寓建築的二樓做為開拓堂址。
雖然當時禮拜堂附近只有二、三棟大廈，但由於「造鎮計劃」十分具開發潛力，於 1992 年 3 月，中崙母會以約 969 萬元購置教會現址，貸款 495 萬，分 20 年償還。
- 1993 年 4 月 18 日 由七星中會派特會員與中崙教會及其子會在此地舉行「開設禮拜」，並派甫自神學院畢業的林琇貴傳道師駐水源教會負責開拓事工。
- 1994 年 11 月 6 日 於中崙教會長執會中決議組織水源教會委員會：母會派鄭興讓牧師、姚喜年長老與佈道所林琇貴傳道師、黃義祿兄、姚芳年兄、林睦幸姊六名組成水源教會委員會。
- 1996 年 4 月 7 日 由許榮豐牧師接任鄭興讓牧師的委員職。
- 1997 年 6 月 1 日 再增江木松兄為委員，共同為聖工努力。
- 1997 年 11 月 2 日 申請成立支會，1998年1月26日升格為支會。
- 1999 年 6 月 20 日 選舉第一屆長執，7 月 18 日長執就任（長老二名、執事三名）。
- 1999 年 9 月 27 日 升格為堂會。
- 1999 年 10 月 17 日 通過監選，聘任林琇貴教師為首任牧師。
- 1999 年 11 月 21 日 舉行獻堂、林琇貴教師封牧暨就任第一任牧師授職感恩禮拜。
- 2001 年 2 月 18 日 補選一位執事(劉子潮)，並於 3 月 11 日就任。
水源佈道所開拓時母會沒有會友住在本地，又欠缺長期固定的種子同工，而最初的三戶會友以前也很少去教會，且傳道者本身缺乏牧會開拓經驗，乃是一面摸索，一 面學習。
雖然有許多的失敗，卻也蒙主保守滿有恩典，並得到許多愛主兄姊的支援、同工、協助，才有今日的水源教會；尤其感謝母會在經濟上的支持，並給予極大 的發展空間。期盼水源教會能夠傳承母會的開拓精神，積極參與 21 世紀的宣教，完成主的託付。
異象：建構「水源教會文化」－喜愛上帝的話語、遵行上帝的誡命，成為「滿有主同在的教會」。
經文：約翰福音十四章二十一節 主耶穌說：「有了我的命令又遵守的，這人就是愛我的。愛我的必蒙我父愛他，我也要愛他，並且要向他顯現。」
目標：使會友成為上帝喜悅的人──有清楚的身份認同（知道自己是上帝的產業、是屬上帝的人）
方法：明白聖經的話、遵行聖經的教訓、體驗生命的改變與更新。
